概要
「ボクは聖女になるっ！」「あ……あなた、男でしょう⁉」
輪暦１千万２０２６年。
ケイ＝ノービスは、聖女になるために現役トップ聖女のソラ・ヘブンズリンクに師事していた。
このたび師の推薦により、晴れて聖女養成学校アカデミーの入学試験を受けられることになり、希望を胸に聖都に上京する。
その道中、教区解放戦線というテロリストに遭遇する。
キ車ジャック事件に巻き込まれ、遅刻しかけながら試験会場に到着するケイ。
そこでアカデミーの一学年主席、ルカ・アリスベータと聖女戦を行うことになる。
他方、男ながら聖女を目指す異常性を危険視され、天輪教会の秘密組織・禁忌聖典がケイを狙って動き始める。
彼に興味を持った教区解放戦線の首魁・サークルクラッシャーも暗躍し、教区全体を巻き込んだ一大事へと発展していく。
しかし少年は、死に別れた