魔法少女ハ、眠ラナイ

震災から5年、中心街をメインに復興しつつある鐘浜市において、少女の行方不明事件の多発が問題となっていた。行方不明になった少女は３～５日後に発見されるケースが多いが、その時には光の凹凸がなくなり、平面上に映し出されたような存在になっているという。これらの”怪異”が身近にある中、学校での用事に時間がかかり一人で帰ることになった仁科望。人気がいない場所に差し掛かった時、彼に”影”が襲い掛かる。その時、深紅の魔法少女が登場し、”影”を討伐する。”影”とは、”魔法少女”とは、そしてそこに込められた残酷な運命とは―。