『神社は全部“封印装置”だったと俺だけが知っている』

普通の高校生・神代ユウトは、ある日“神社は神を祀っていない”という事実に気づく。

そこは祈りの場所ではなく、
かつて世界を滅ぼしかけた“存在”を封じる装置だった。

そして各地の神社には、それぞれ異なる「封印機構」が存在し、
破壊されれば封印は解け、災厄が現世に戻る。

しかし、なぜかユウトだけがその構造を“見抜ける”。

やがて彼は知る。
自分自身もまた、封印と深く関係する存在だということを──。