シミュレーションの成績以外ポンコツな俺が、なぜかAI少女だけの無人戦闘機隊を率いる事になりました

西暦2392年、人類は異星種族「ミナトス」に追い詰められていた。
士官候補生、アマギ・ショウマはシミュレーション成績以外は落第寸前の落ちこぼれ。それがどういう訳か戦闘機隊の指揮官に抜擢される。
疑問が浮かぶ中で着任したアマギだったが、その部隊は有人ではなく、少女の人格を模したAIが操縦する戦闘機部隊だった――。

※書きたい要素を優先するので各エピソードが若干長めになります。