宇宙の片隅、宇宙船スクラップの部品取りで生計を立てていた男、名はカイト。
ある時ボロボロの宇宙船がスクラップ置き場に砂に埋もれているのを見つける。あまり見た事の無い形の宇宙船。カイトはそれを持ち帰りコツコツと改修し、アークと名付ける。
しかし、その船は旧世代の異物、どこか謎の多い船だった。
やがて、メインコンピューターが目覚めると、それは皮肉たっぷりの、AIだった。
カイトのオリジナル理論で改造された、推進機構を使いその船は遥かな宇宙船の墓場へと旅に出る。
宇宙船の墓場には、アークの同型艦、その中に眠る一人の少女、それは、、、