黒田官兵衛討伐後、武蔵と石原さとみは王都へ向かう。王都では、有馬新七なる剣豪が、秘術たる魔法を弄し、民を苦しめているとの噂が流布していた。有馬新七は、かつて新選組の前身、壬生浪士組に所属し、その剣技は武蔵に比肩するとも言われる存在であった。有馬新七は本来は薩摩藩士だが、歴史が変わってる。

　王都に到着した二人は、有馬新七の悪行を目の当たりにする。彼は、魔法の力で民を傀儡とし、財を奪い、逆らう者には容赦なき剣を振るっていた。武蔵は、有馬新七の暴走を止めるべく、彼に決闘を申し込む。

　有馬新七は、武蔵の申し出を受け入れ、王都を一望する清水寺にて対峙する。有馬新七は、魔法を剣に纏わせ、神速の剣技で武蔵に襲い掛かる。武蔵もまた、魔法と剣技を融合させた独自の戦闘様式で応戦する。

　両者の戦いは、凄惨を極めた。剣と魔法が激突し、周囲の景観が変貌するほどの激戦が繰り広げられた。有馬新七の剣は、武蔵の魔法防御を切り裂き、武蔵の剣は、有馬新七の魔法攻撃を打ち砕く。

　戦闘中、武蔵は、有馬新七の剣に、深い悲哀の感情が込められていることを察知する。有馬新七は、かつて新選組において、多くの同胞を喪失し、その悲嘆から、力を求め、魔法に手を染めたのであった。

　武蔵は、有馬新七の悲哀に共感を覚え、彼を救済したいと願う。そして、自身の内なる力を探求し、有馬新七の心の傷を癒すための新技を創出する。それは、魔法の力を剣に込め、対戦者の心の傷を癒す、慈悲の剣であった。

　武蔵の慈悲の剣は、有馬新七の深層心理に響き、彼の心を浄化する。有馬新七は、自身の過誤を認識し、武蔵に謝意を示し、戦いを終結させる。

　有馬新七との戦いを終えた武蔵と石原さとみは、王都の民から謝意を受け、英雄として称えられる。二人は、魔法の力を民のために用いることの尊さを再認識し、新たな旅路へと出発する。

　王都での出来事を経て、武蔵と石原さとみは、それぞれの道を選択する。武蔵は、自身の剣と魔法の力を更なる高みへと昇華させるため、修行の旅に出ることを決意する。一方、石原さとみは、魔法の力で民を救済するため、各地の村を訪れることを決意する。

　二人は、互いの決意を尊重し、別離の時を迎える。しかし、両者の絆は、決して断絶することはなかった。彼らは、再会し、共に戦うことを信じていた。

　武蔵は、修行の旅において、様々な強敵と対峙し、自身の剣と魔法の力を練磨する。彼は、剣の道のみならず、魔法の道も極め、独自の戦闘様式を完成させる。

　一方、石原さとみは、各地の村において、魔法の力で民を救済し、感謝される。彼女は、魔法の力のみならず、民の心の苦痛にも寄り添い、癒していく。

　二人は、それぞれの道を進みながらも、互いを想い、成長していく。そして、彼らの成長は、新たな出会いと戦いへと繋がっていく。